Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF8Q3BBV2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF8Q3BBV2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms