Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms