Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX7Q2KHR2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms