Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYPL1Q16563 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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