Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
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NCOA1Q15788 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
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NCOA1Q15788 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
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NCOA1Q15788 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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NCOA1Q15788 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA1Q15788 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA1Q15788 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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