Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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