Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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