Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK3Q15120 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms