Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GAPVD1Q14C86 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GAPVD1Q14C86 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GAPVD1Q14C86 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
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