Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME4Q14997 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME4Q14997 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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