Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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COL4A6Q14031 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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COL4A6Q14031 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
COL4A6Q14031 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL4A6Q14031 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL4A6Q14031 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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