Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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CNGB1Q14028 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGB1Q14028 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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