Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA5AQ13591 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA5AQ13591 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms