Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGB3BPQ13352 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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