Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SKP2Q13309 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKP2Q13309 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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