Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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