Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAF3Q13114 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms