Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFT88Q13099 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms