Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFX1Q12986 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFX1Q12986 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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