Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN5Q08AF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms