Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBQ06643 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LTBQ06643 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms