Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABPB1Q06547 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms