Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC9Q06265 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms