Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKCDQ05655 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms