Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN1Q04323 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN1Q04323 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms