Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MYBPC1Q00872 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms