Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDPQ00604 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDPQ00604 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms