Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDKL1Q00532 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKL1Q00532 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms