Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMF1P82094 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMF1P82094 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMF1P82094 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMF1P82094 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMF1P82094 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms