Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX5P78411 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX5P78411 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX5P78411 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX5P78411 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX5P78411 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX5P78411 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms