Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS28P62857 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms