Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms