Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113P62684 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms