Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF6P62330 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF6P62330 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms