Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB2AP61019 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms