Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA3P59666 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA3P59666 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms