Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA1P59665 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DEFA1P59665 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms