Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABP4P57796 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP4P57796 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CABP4P57796 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CABP4P57796 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP4P57796 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms