Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2BFSP57053 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms