Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB3P54284 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms