Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP3M2P53677 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AP3M2P53677 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms