Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX2P52951 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX2P52951 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX2P52951 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX2P52951 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX2P52951 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GBX2P52951 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBX2P52951 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms