Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP153P49790 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP153P49790 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP153P49790 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms