Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF4P48230 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF4P48230 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms