Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL1P40616 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL1P40616 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL1P40616 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL1P40616 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL1P40616 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL1P40616 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL1P40616 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARL1P40616 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL1P40616 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL1P40616 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms