Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPGP40121 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPGP40121 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPGP40121 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPGP40121 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms