Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2IP36954 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms