Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
THBS4P35443 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
THBS4P35443 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms