Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFNP31947 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFNP31947 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFNP31947 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFNP31947 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFNP31947 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFNP31947 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFNP31947 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFNP31947 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFNP31947 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFNP31947 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFNP31947 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms