Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms